Mi primer contacto profesional con la bioinformática fue en 2001, cuando acepté un puesto como investigador en la Unidad de Biomarcadores y Susceptibilidad del Instituto Catalán de Oncología (ICO), bajo la supervisión del Prof. Víctor Moreno. Durante ese tiempo estuve involucrado en múltiples proyectos, con un énfasis especial en el perfilado de CRC con microarrays para identificar firmas de pronóstico y metástasis. Durante esos años, también desarrollé un interés en la susceptibilidad al cáncer y la genética de poblaciones. Creé la herramienta web SNPStats para el análisis de estudios de asociación genética a pequeña escala. La herramienta ha demostrado ser extremadamente exitosa, con más de 1680 citas a día de hoy. Tras el éxito de la herramienta, me invitaron a escribir un capítulo de libro sobre el análisis de datos de estudios de asociación. En 2007, comencé mi doctorado en el ICO bajo la supervisión del Prof. Moreno y el Dr. Miguel A. Pujana. Mi tesis se centró en la integración de múltiples tipos de datos ómicos a gran escala para comprender mejor las bases moleculares de diferentes tipos de tumores. La tesis, que comprendía tres artículos publicados como primer autor, se defendió en febrero de 2012 y obtuvo el grado más alto posible, excelente cum laude. En 2008, después de recibir una beca de viaje de la UICC, pasé 3 meses en la Universidad de Columbia (NY), formándome bajo la supervisión de los Profesores Andrea Califano y Adolfo Ferrando. Durante esa visita, profundicé mi conocimiento en la biología de sistemas y el cáncer, así como la experiencia adquirida en la inferencia de redes transcripcionales con datos de expresión génica. Durante la visita contribuí a la publicación de dos manuscritos en la revista Nature Medicine como colaborador. En noviembre de 2012, después de obtener una beca postdoctoral del Ministerio de Sanidad español, me incorporé al laboratorio del Dr. Sridhar Ramaswamy en el Massachusetts General Hospital / Harvard Medical School. El enfoque de mi trabajo allí fue hacer una caracterización a múltiple escala de células tumorales no proliferativas mediante el análisis e integración de múltiples tipos de conjuntos de datos ómicos a gran escala. Este proyecto me permitió ampliar mi experiencia en el análisis integrativo de datos ómicos, así como fortalecer mi experiencia en la biología molecular del cáncer y los procesos de la regulación de la transcripción. En total, mi postdoctorado generó 7 publicaciones, 3 de ellas como primer autor.

Actualmente, dirijo la Unidad de Bioinformática para Oncología de Precisión (UBOP) en el Instituto Catalán de Oncología. Desde la UBOP nos encargamos de diseñar, implementar y mantener todos los análisis bioinformáticos relacionados con el diagnóstico molecular avanzado con NGS de pacientes de cáncer en la rutina clínica, tanto a nivel germinal como somático. La UBOP también centra parte de su actividad en la investigación en el campo de la oncología de precisión, habiendo establecido colaboraciones con otros grupos de investigación del instituto y de otros centros, tanto nacionales como internacionales.

En total, he participado en 37 publicaciones y soy investigador principal de un proyecto de investigación competitivo financiado por el MICINN, centrado en la estratificación de pacientes de cáncer de pulmón más allá de los marcadores genómicos tradicionales, así como en la identificación de alternativas terapéuticas específicas para los pacientes.