{rfName}
Ne

Indexat a

Llicència i ús

Altmetrics

Grant support

Supported by a National Cancer Institute Strategic Partnering to Evaluate Cancer Signatures (SPECS II) grant (5U01CA157581-05) and in part by the Leukemia and Lymphoma Society of Canada and the Terry Fox Research Institute (Grant No. 1061). The BC Cancer Agency Centre for Lymphoid Cancer clinical database is supported by Roche. The research at the City of Hope was supported in part by the National Cancer Institute (award No. P30CA033572). The research at the University of Nebraska Medical Center was supported by the Fred & Pamela Buffett Cancer Center's National Cancer Institute Cancer Center Support Grant (P30CA036727). Research at Oslo University Hospital was supported by The Research Council of Norway's Centres of Excellence Scheme Research Council (Project No. 179571). D.W.S. is supported by the BC Cancer Agency. P.A.'s fellowship at the BC Cancer Agency was supported by funds from Vall d'Hebron University Hospital, Barcelona, Spain. G.W.W. is supported by the Division of Cancer Treatment and Diagnosis, National Cancer Institute, Bethesda, MD. A.M. is supported by fellowship awards from the Mildred-Scheel-Cancer Foundation, the Michael Smith Foundation for Health Research, and Lymphoma Canada. G.O. is supported by the Robert-Bosch-Foundation, Stuttgart, Germany. H.H. is supported by the Norwegian Cancer Society. E.S.J. and L.M.S. are supported by the Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD. C.S. is the recipient of a Career Investigator Award from the Michael Smith Foundation for Health Research. J.M.C. received research funding support from the Terry Fox Research Institute, Genome Canada, Genome British Columbia, the Canadian Institutes for Health Research, and the BC Cancer Foundation. E.C. was supported in part by the Ministerio de Economia y Competitividad Grant No. SAF2015-64885-R, Generalitat de Catalunya Suport Grups de Recerca 2014-SGR-795, and Institucio Catalana de Recerca i Estudis Avancats. L.M.R.'s laboratory infrastructure and tissue banking are supported by awards from the National Cancer Institute Specialized Program in Research Excellence (5P50CA097274) and the Mayo Comprehensive Cancer Center (5P30CA015083).

Anàlisi d'autories institucional

Jares PAutor o coautorRoyo CAutor o coautorClot GAutor o coautorPinyol MAutor o coautorCampo EAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

New Molecular Assay for the Proliferation Signature in Mantle Cell Lymphoma Applicable to Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Biopsies.

Publicat a:Journal Of Clinical Oncology. 35 (15): 1668-+ - 2017-05-20 35(15), DOI: 10.1200/jco.2016.70.7901

Autors: Scott, David W; Abrisqueta, Pau; Wright, George W; Slack, Graham W; Mottok, Anja; Villa, Diego; Jares, Pedro; Rauert-Wunderlich, Hilka; Royo, Cristina; Clot, Guillem; Pinyol, Magda; Boyle, Merrill; Chan, Fong Chun; Braziel, Rita M; Chan, Wing C; Weisenburger, Dennis D; Cook, James R; Greiner, Timothy C; Fu, Kai; Ott, German; Delabie, Jan; Smeland, Erlend B; Holte, Harald; Jaffe, Elaine S; Steidl, Christian; Connors, Joseph M; Gascoyne, Randy D; Rosenwald, Andreas; Staudt, Louis M; Campo, Elias; Rimsza, Lisa M

Afiliacions

BC Canc Agcy, Vancouver, BC, Canada - Autor o coautor
City Hope Natl Med Ctr, Duarte, CA USA - Autor o coautor
Cleveland Clin, Pathol & Lab Med Inst, Cleveland, OH 44106 USA - Autor o coautor
Dr Margarete Fischer Bosch Inst Clin Pharmacol, Stuttgart, Germany - Autor o coautor
Mayo Clin, Phoenix, AZ USA - Autor o coautor
NIH, Bldg 10, Bethesda, MD 20892 USA - Autor o coautor
Oregon Hlth & Sci Univ, Portland, OR 97201 USA - Autor o coautor
Oslo Univ Hosp, Oslo, Norway - Autor o coautor
Robert Bosch Krankenhaus, Stuttgart, Germany - Autor o coautor
Univ Barcelona, Inst Invest Biomed August Pi i Sunyer, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ British Columbia, Vancouver, BC, Canada - Autor o coautor
Univ Nebraska, Med Ctr, Omaha, NE USA - Autor o coautor
Univ Toronto, Toronto, ON, Canada - Autor o coautor
Univ Wurzburg, Wurzburg, Germany - Autor o coautor
Vall Hebron Univ Hosp, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Purpose Mantle cell lymphoma is an aggressive B-cell neoplasm that displays heterogeneous outcomes after treatment. In 2003, the Lymphoma/Leukemia Molecular Profiling Project described a powerful biomarker-the proliferation signature-using gene expression in fresh frozen material. Herein, we describe the training and validation of a new assay that measures the proliferation signature in RNA derived from routinely available formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) biopsies. Methods Forty-seven FFPE biopsies were used to train an assay on the NanoString platform, using microarray gene expression data of matched fresh frozen biopsies as a gold standard. The locked assay was applied to pretreatment FFPE lymph node biopsies from an independent cohort of 110 patients uniformly treated with rituximab plus cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone. Seventeen biopsies were tested across three laboratories to assess assay reproducibility. Results The MCL35 assay, which contained a 17-gene proliferation signature, yielded gene expression of sufficient quality to assign an assay score and risk group in 108 (98%) of 110 archival FFPE biopsies. The MCL35 assay assigned patients to high-risk (26%), standard-risk (29%), and low-risk (45%) groups, with different lengths of overall survival (OS): a median of 1.1, 2.6, and 8.6 years, respectively (log-rank for trend, P < .001). In multivariable analysis, these risk groups and the Mantle Cell Lymphoma International Prognostic Index were independently associated with OS ( P < .001 for both variables). Concordance of risk assignment across the three independent laboratories was 100%. Conclusion The newly developed and validated MCL35 assay for FFPE biopsies uses the proliferation signature to define groups of patients with significantly different OS independent of the Mantle Cell Lymphoma International Prognostic Index. Importantly, the analytic and clinical validity of this assay defines it as a reliable biomarker to support risk-adapted clinical trials.

Paraules clau
follow-upgene-expressionimmunochemotherapyprognostic indexrandomized-trialsrisksurvivaltimetissueEuropean-mcl-network

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Journal Of Clinical Oncology a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2017, es trobava a la posició 4/223, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Oncology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 2.64. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 2.69 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 25.63 (font consultada: Dimensions May 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-05-20, el següent nombre de cites:

  • WoS: 90
  • Scopus: 96
  • Europe PMC: 6
  • OpenCitations: 98
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-20:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 106.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 106 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 12.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 17 (Altmetric).
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Canada; Germany; Norway; United States of America.