{rfName}
Di

Indexat a

Llicència i ús

Altmetrics

Grant support

This work was supported by Asociacion Espanola Contra el Cancer (AECC CICPFI6025SALA), Fondo de Investigaciones Sanitarias Instituto de Salud Carlos III (Miguel Servet Program CP13/00159 and PI15/00580 to I.S.), Spanish Ministerio de Economia y Competitividad (SAF201564885-R to E.C.), Generalitat de Catalunya Suport Grups de Recerca (2017-SGR-1107 to I.S. and 2017-SGR-1142 to E.C.), SPECS II grant (National Cancer Institute 1U01CA157581), and the European Regional Development Fund (Una manera de fer Europa). J.E.R.-Z. was supported by a fellowship from Generalitat de Catalunya AGAUR FI-DGR 2017 (2017 FI_B01004). E.C. is an Academia Researcher of the Institucio ' Catalana de Recerca i Estudis Avancats of the Generalitat de Catalunya. This work was developed at the Centro Esther Koplowitz, Barcelona, Spain. The group is supported by Accioinstrumental d'incorporacio de cientifics i tecnolegs PERIS 2016 (SLT002/16/00336 to Noelia Garcia) from Generalitat de Catalunya.

Anàlisi d'autories institucional

Ramis-Zaldivar JeAutor o coautorRamis Zaldivar, Joan EnricAutor o coautorGonzalez-Farre BAutor o coautorBalagué Ponz, OlgaAutor o coautorNadeu FAutor o coautorSalmeron-Villalobos JAutor o coautorDlouhy IAutor o coautorClot GAutor o coautorEnjuanes AAutor o coautorLópez-Guillermo AAutor o coautorCampo EAutor o coautorSalaverria IAutor (correspondència)
Compartir
Publicacions
>
Article

Distinct molecular profile of IRF4-rearranged large B-cell lymphoma

Publicat a:Blood. 135 (4): 274-286 - 2020-01-23 135(4), DOI: 10.1182/blood.2019002699

Autors: Enric Ramis-Zaldivar, Joan; Gonzalez-Farre, Blanca; Balague, Olga; Celis, Veronica; Nadeu, Ferran; Salmeron-Villalobos, Julia; Andres, Mara; Martin-Guerrero, Idoia; Garrido-Pontnou, Marta; Gaafar, Ayman; Sunol, Mariona; Barcena, Carmen; Garcia-Bragado, Federico; Andion, Maitane; Azorin, Daniel; Astigarraga, Itziar; Sagaseta de Ilurdoz, Maria; Sabado, Constantino; Gallego, Soledad; Verdu-Amoros, Jaime; Fernandez-Delgado, Rafael; Perez, Vanesa; Tapia, Gustavo; Mozos, Anna; Torrent, Montserrat; Solano-Paez, Palma; Rivas-Delgado, Alfredo; Dlouhy, Ivan; Clot, Guillem; Enjuanes, Anna; Lopez-Guillermo, Armando; Galera, Pallavi; Oberley, Matthew J; Maguire, Alanna; Ramsower, Colleen; Rimsza, Lisa M; Quintanilla-Martinez, Leticia; Jaffe, Elaine S; Campo, Elias; Salaverria, Itziar

Afiliacions

Childrens Hosp Los Angeles, Dept Pathol & Lab Med, Los Angeles, CA USA - Autor o coautor
Complejo Hosp Navarra, Pathol Dept, Pamplona, Spain - Autor o coautor
Complejo Hosp Navarra, Pediat Oncol Dept, Pamplona, Spain - Autor o coautor
Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain - Autor o coautor
Eberhard Karls Univ Tubingen, Univ Hosp Tubingen, Inst Pathol, Tubingen, Germany - Autor o coautor
Hosp Clin Univ Valencia, Pediat Oncol Dept, Valencia, Spain - Autor o coautor
Hosp St Joan de Deu, Pathol Dept, Esplugas de Llobregat, Spain - Autor o coautor
Hosp St Joan de Deu, Pediat Oncol Dept, Esplugas de Llobregat, Spain - Autor o coautor
Hosp St Pau & Santa Creu, Pathol Dept, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp St Pau & Santa Creu, Pediat Oncol Dept, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Trias & Pujol, Pathol Dept, Badalona, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ & Politecn La Fe Valencia, Pediat Oncol Dept, Valencia, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ 12 Octubre, Pathol Dept, Madrid, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ 12 Octubre, Pediat Oncol Dept, Madrid, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Cruces Osakidetza, Biocruces Bizkaia Hlth Res Inst, Pathol Dept, Baracaldo, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Cruces Osakidetza, Biocruces Bizkaia Hlth Res Inst, Pediat Oncol Unit, Baracaldo, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Infant Nino Jesus, Pathol Dept, Madrid, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Infant Nino Jesus, Pediat Oncol Dept, Madrid, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Vall dHebron, Pathol Dept, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Univ Vall dHebron, Pediat Oncol Dept, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Virgen Rocio, Pediat Oncol Dept, Seville, Spain - Autor o coautor
Inst Invest Biomed August Pi i Sunyer, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Mayo Clin, Dept Lab Med & Pathol, Phoenix, AZ USA - Autor o coautor
Mayo Clin, Dept Res, Scottsdale, AZ USA - Autor o coautor
NIH, Lab Pathol, Bldg 10, Bethesda, MD 20892 USA - Autor o coautor
Univ Barcelona, Hosp Clin Barcelona, Hematopathol Unit, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ Basque Country, Univ Pais Vasco, Fac Sci & Technol, Dept Genet Phys Anthropol & Anim Physiol, Leioa, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Pediatric large B-cell lymphomas (LBCL) share morphological and phenotypic features with adult types but have better prognosis. The higher frequency of some subtypes such as LBCL with IRF4 rearrangement (LBCL-IRF4) in children, suggests that some age-related biological differences may exist. To characterize the genetic and molecular heterogeneity of these tumors, we studied 31 diffuse large B-cell lymphomas, not otherwise specified (DLBCL, NOS), 20 LBCL-IRF4, and 12 high grade B-cell lymphomas, NOS (HGBCL, NOS) in patients {less than or equal to}25 years-old using an integrated approach including targeted gene sequencing, copy number arrays and gene expression profiling. Each subgroup displayed different molecular profiles. LBCL-IRF4 had frequent mutations in IRF4 and NF-kB pathway genes (CARD11, CD79B and MYD88), losses of 17p13 and gains of chr7, 11q12.3-q25 whereas DLBCL,NOS were predominantly of germinal center B-cell (GCB) subtype and carried gene mutations similar to the adult counterpart (e.g. SOCS1 and KMT2D), gains of 2p16/REL and losses of 19p13/CD70. A subset of HGBCL, NOS displayed recurrent alterations of Burkitt lymphoma related genes such as MYC, ID3 and DDX3X and homozygous deletions of 9p21/CDKN2A whereas other cases were genetically closer to GCB-DLBCL. Factors related to unfavorable outcome were age >18y old, activated B-cell DLBCL profile, HGBCL, NOS, high genetic complexity, 1q21-q44 gains, 2p16/REL gains/amplifications, 19p13/CD70 homozygous deletions, and TP53 and MYC mutations. In conclusion, these findings further unravel the molecular heterogeneity of pediatric/young-adult LBCL, improve the classification of this group of tumors and provide new parameters for risk stratification.Copyright © 2019 American Society of Hematology.

Paraules clau
childrenclassificationfollicular lymphomafrequentgene-expressiongenomehigh-resolutionmutationspathogenesisAdolescentAdultBurkitt-lymphomaChildChild, preschoolFemaleHumansInterferon regulatory factor-4Interferon regulatory factorsLymphoma, large b-cell, diffuseMaleMutationPrognosisTranscriptomeYoung adult

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Blood a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 1/76, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Hematology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 4.1. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 4.05 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 27.09 (font consultada: Dimensions May 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-05-13, el següent nombre de cites:

  • WoS: 94
  • Scopus: 98
  • Europe PMC: 40
  • OpenCitations: 92
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-13:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 84.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 89 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 6.75.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 6 (Altmetric).
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Germany; United States of America.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Ramis Zaldivar, Joan Enric) i Últim Autor (Salaverria Frigola, Itziar).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Salaverria Frigola, Itziar.