{rfName}
Ge

Llicència i ús

Licencia

Altmetrics

Grant support

Laia Bonjoch was supported by a Juan de la Cierva postdoctoral contract (FJCI-2017-32593). Sebastia Franch-Exposito, Coral Arnau-Collell, Jenifer Munoz, and Cristina Herrera-Pariente were supported by a contract from CIBEREHD. Marcos Diaz-Gay was supported by a contract from Agencia de Gestio d'Ajuts Universitaris i de Recerca-AGAUR-(Generalitat de Catalunya, 2019FI_B2_00203) and Yasmin Soares de Lima was awarded an INPhINIT fellowship (LCF/BQ/DI18/11660058) from la Caixa Foundation (ID 100010434 funded by the EU Horizon 2020 Programme Marie Sklodowska-Curie grant agreement no. 713673). CIBEREHD, CIBERER, and CIBERONC are funded by the Instituto de Salud Carlos III. This research was supported by grants from Fondo de Investigacion Sanitaria/FEDER (16/01292, 17/00878), Fundacion Cientifica de la Asociacion Espanola contra el Cancer (GCB13131592CAST), Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities, co-funded by FEDER funds (SAF2016-80888-R, BIO201789754-C2-2R), PERIS (SLT002/16/00398, SLT002/16/0037, Generalitat de Catalunya), CERCA Program (Generalitat de Catalunya), and Agencia de Gestio d'Ajuts Universitaris i de Recerca (Generalitat de Catalunya, GRPRE 2017SGR21, GRC 2017SGR653, 2017SGR723, 2017SGR861, 2017SGR1282). This article is based on work from COST Action CA17118, supported by COST (European Cooperation in Science and Technology). www.cost.eu.

Anàlisi d'autories institucional

Bonjoch Gassol, LaiaAutor o coautorFranch-Expósito SAutor o coautorMuñoz JAutor o coautorArnau-Collell CAutor o coautorDíaz-Gay MAutor o coautorRaimondi GAutor o coautorEsteban-Jurado CAutor o coautorSoares De Lima YAutor o coautorHerrera-Pariente, CAltresCuatrecasas MAutor o coautorOcana, TAutor o coautorCastells AAutor o coautorFillat CAutor o coautorBalaguer FAutor o coautorCastellvi-Bel SAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

Germline Mutations in FAF1 Are Associated With Hereditary Colorectal Cancer

Publicat a:Gastroenterology. 159 (1): 227-+ - 2020-07-01 159(1), DOI: 10.1053/j.gastro.2020.03.015

Autors: Bonjoch, Laia; Franch-Exposito, Sebastia; Garre, Pilar; Belhadj, Sami; Munoz, Jenifer; Arnau-Collell, Coral; Diaz-Gay, Marcos; Gratacos-Mulleras, Anna; Raimondi, Giulia; Esteban-Jurado, Clara; Soares de Lima, Yasmin; Herrera-Pariente, Cristina; Cuatrecasas, Miriam; Ocana, Teresa; Castells, Antoni; Fillat, Cristina; Capella, Gabriel; Balaguer, Francesc; Caldes, Trinidad; Valle, Laura; Castellvi-Bel, Sergi

Afiliacions

Ctr Invest Biomed Red Canc CIBERONC, Catalan Inst Oncol, Inst Invest Biomed Bellvitge IDIBELL, Hereditary Canc Program,Oncobell, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Clin Barcelona, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Pathol Dept, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Clin Barcelona, Tumor Bank Biobank, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp Clin San Carlos, Mol Oncol Lab, Ctr Invest Biomed Red Canc CIBERONC, Inst Invest Sanitaria San Carlos IdISSC, Madrid, Spain - Autor o coautor
Univ Barcelona, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Raras CIBERER, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Gene Therapy & Canc, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ Barcelona, Hosp Clin, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAP,Gast, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

A significant proportion of colorectal cancer (CRC) cases have familial aggregation but little is known about the genetic factors that contribute to these cases. We performed an exhaustive functional characterization of genetic variants associated with familial CRC.We performed whole-exome sequencing analyses of 75 patients from 40 families with a history of CRC (including early-onset cases) of an unknown germline basis (discovery cohort). We also sequenced specific genes in DNA from an external replication cohort of 473 families, including 488 patients with colorectal tumors that had normal expression of mismatch repair proteins (validation cohort). We disrupted the Fas-associated factor 1 gene (FAF1) in DLD-1 CRC cells using CRISPR/Cas9 gene editing; some cells were transfected with plasmids that express FAF1 missense variants. Cells were analyzed by immunoblots, quantitative real-time polymerase chain reaction, and functional assays monitoring apoptosis, proliferation, and assays for Wnt signaling or nuclear factor (NF)-?B activity.We identified predicted pathogenic variant in the FAF1 gene (c.1111G>A; p.Asp371Asn) in the discovery cohort; it was present in 4 patients of the same family. We identified a second variant in FAF1 in the validation cohort (c.254G>C; p.Arg85Pro). Both variants encoded unstable FAF1 proteins. Expression of these variants in CRC cells caused them to become resistant to apoptosis, accumulate b-catenin in the cytoplasm, and translocate NF-?B to the nucleus.In whole-exome sequencing analyses of patients from families with a history of CRC, we identified variants in FAF1 that associate with development of CRC. These variants encode unstable forms of FAF1 that increase resistance of CRC cells to apoptosis and increase activity of b-catenin and NF-?B.Copyright © 2020 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

Paraules clau

apoptosisfunctional genomicsgene editinggenetic-variantsguidelineslymphomapathwaypredispositionprogrammed cell deathproteinrisksubunitAdaptor proteins, signal transducingAgedApoptosisApoptosis regulatory proteinsBeta cateninCancer colorectalCell deathCell line, tumorColorectal cancerColorectal neoplasmsCtnnb1 protein, humanDna mutational analysisExome sequencingFaf1 protein, humanFas-associated factor-1FemaleFunctional genomicsGene editingGene knockout techniquesGenetic predisposition to diseaseGerm-line mutationHumansMaleMiddle agedMort cel·lularMutagenesis, site-directedNeoplastic syndromes, hereditaryNf-kappa bPedigreeProgrammed cell deathWnt signalingWnt signaling pathway

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Gastroenterology a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 4/92, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Gastroenterology & Hepatology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.16, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 4.81 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-17, el següent nombre de cites:

  • WoS: 21
  • Scopus: 22
  • Europe PMC: 17
  • Google Scholar: 22
  • OpenCitations: 17

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-17:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 64.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 64 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 36.4.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 36 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Bonjoch L) i Últim Autor (Castellví Bel, Sergi).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Castellví Bel, Sergi.