{rfName}

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Grant support

This study was partially supported by Bristol-Myers Squibb. M. Puigveh? received a scholarship grant from Asociacion Espanola para el Estudio del Higado (AEEH) . P.K. Haber is the recipient of a grant from the German Research Foundation (DFG, HA 8754/1-1) . M. Garc?a-Lo?pez is supported by the i-PFIS program (fellowship IFI18/00006) of the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) , cofunded by the European Social Fund. R. Esteban-Fabro? is supported by a doctoral training grant (BES-2017-081286) from MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and the European Social Fund (ESF) . A.R. Varadarajan is supported by the US Department of Defense grant (CA150272P3) and the Tisch Cancer Institute (Cancer Center grant P30 CA196521) . S. Pe?rez-del-Pulgar is supported by the ISCIII through the Plan Estatal de Investigacio?n Cient?fica y Te?cnica y de Innovacio?n 2013-2016 and 2017-2020 cofunded by the European Regional Devel-opment Fund (ERDF; PI16/00111 and PI19/00036) . J. Zucman-Rossi?s team is supported by Inserm, Labex OncoImmunology Investissement d'Avenir and is Equipe labellisee par la Ligue Nationale Contre le Cancer.X. Forns is supported by the ISCIII through the Plan Estatal de Investigacio?n Cient?fica y Te?cnica y de Innovacio?n 2013-2016 and 2017-2020 cofunded by the ERDF (PI18/00079) , by the Secretaria d'Universitats i Recerca del Departament d'Economia i Coneixement (grant 2017_SGR_1753) , and by CERCA Programme/Generalitat de Catalunya. D. Sia is supported by the Gilead Sciences Research Scholar Program in Liver Disease. J.M. Llovet is supported by grants from the Samuel Waxman Cancer Research Foundation, the Spanish National Health Institute (MICINN, PID2019-105378RB-I00) , NIH (R01 DK128289-01) , HUNTER (Ref. C9380/A26813) through a partnership between Cancer Research UK, Fondazione AIRC and Fundacion Cientifica de la Asociacion Espanola Contra el Cancer and by the Generalitat de Catalunya (AGAUR, SGR-1358) . We thank Clara Rossi, a Fellow at Mount Sinai, and Luca Niebla, an MD student at the University of Barcelona, for their help.

Anàlisi d'autories institucional

Torres De Dalmases, Maria Del CarmenAutor o coautorTorrens LAutor o coautorTorres-Martín MAutor o coautorLeonel TAutor o coautorGarcía-López MAutor o coautorEsteban-Fabró RAutor o coautorMontironi CAutor o coautorTorrecilla SAutor o coautorCamprecios GAutor o coautorVillanueva AAutor o coautorPerez-Del-Pulgar SAutor o coautorForns XAutor o coautorLlovet JmAutor (correspondència)

Compartir

24 d’agost de 2022
Publicacions
>
Article

Hepatocellular carcinoma in Mongolia delineates unique molecular traits and a mutational signature associated with environmental agents

Publicat a:Clinical Cancer Research. 28 (20): 4509-4520 - 2022-10-15 28(20), DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-22-0632

Autors: Torrens, L; Puigvehí, M; Torres-Martín, M; Wang, H; Maeda, M; Haber, PK; Leonel, T; García-López, M; Esteban-Fabró, R; Leow, WQ; Montironi, C; Torrecilla, S; Varadarajan, AR; Taik, P; Campreciós, G; Enkhbold, C; Taivanbaatar, E; Yerbolat, A; Villanueva, A; Pérez-del-Pulgar, S; Thung, S; Chinburen, J; Letouzé, E; Zucman-Rossi, J; Uzilov, A; Neely, J; Forns, X; Roayaie, S; Sia, D; Llovet, JM

Afiliacions

Bristol Myers Squibb, Princeton, NJ USA - Autor o coautor
Hospital Clinic of Barcelona, Barcelona, spain, Spain. - Autor o coautor
Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA - Autor o coautor
Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Med, Tisch Canc Inst, Liver Canc Program,Div Liver Dis, New York, NY 10029 USA - Autor o coautor
Icahn Sch Med Mt Sinai, Icahn Inst Data Sci & Genom Technol, New York, NY 10029 USA - Autor o coautor
Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York, United States. - Autor o coautor
IDIBAPS, Barcelona, Spain. - Autor o coautor
IMIM Hosp del Mar Med Res Inst, Parc Salut Mar, Hepatol Sect, Dept Gastroenterol, Barcelona, Spain - Autor o coautor
INSERM, Paris, France. - Autor o coautor
Inst Catalana Recerca & Estudis Avancats ICREA, Barcelona, Catalonia, Spain - Autor o coautor
Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), Barcelona, Catalonia, Spain. - Autor o coautor
Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)-Hospital Clínic, Universitat De Barcelona, Barcelona, Barcelona, Spain. - Autor o coautor
Natl Canc Ctr, Hepatopancreat Biliary Surg Dept, Ulan Bator, Mongolia - Autor o coautor
Natl Canc Ctr, Ulaanbaatar, Mongolia - Autor o coautor
Sema4, Stamford, CT USA - Autor o coautor
Singapore Gen Hosp, Dept Anat Pathol, Singapore, Singapore - Autor o coautor
Univ Barcelona, CIBEREHD, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Liver Unit,Hosp Clin, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ Barcelona, Hosp Clin, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Translat Res Hepat Oncol,Liver Unit, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ Paris 13, Univ Paris, Sorbonne Univ, Ctr Rech Cordeliers,Inserm,Funct Genom Solid Tumo, Paris, France - Autor o coautor
White Plains Hosp, Dept Surg, White Plains, NY USA - Autor o coautor
Veure més

Resum

Mongolia has the world's highest incidence of hepatocellular carcinoma (HCC), with ~100 cases/105 inhabitants, although the reasons for this feature have not been thoroughly delineated.We performed a molecular characterization of Mongolian (n=192) compared to Western HCCs (n=187) by RNA-seq and WES to unveil distinct genomic and transcriptomic features associated with environmental factors in this population.Mongolian patients were younger, with higher female prevalence, and with predominantly HBV-HDV co-infection etiology. Mongolian HCCs presented significantly higher rates of protein-coding mutations (121 vs 70 mutations per tumor in Western), and in specific driver HCC genes (i.e. APOB, TSC2). Four mutational signatures characterized Mongolian samples, one of which was novel (SBS Mongolia) and present in 25% of Mongolian HCC cases. This signature showed a distinct substitution profile with a high proportion of T>G substitutions and was significantly associated with exposure to the environmental agent dimethyl sulfate (DMS, 71%), a 2A carcinogenic associated with coal combustion. Transcriptomic-based analysis delineated two molecular clusters, one with a highly inflamed profile, not present in Western HCC, and that were significantly associated with HBV-HDV etiology and female gender.Mongolian HCC has unique molecular traits with a high mutational burden and a novel mutational signature associated with genotoxic environmental factors present in this country.

Paraules clau

cancergenotypeshigh prevalencelandscapeprecorernatriple infectionAdultAgedAmino acid substitutionApob geneApolipoprotein bApolipoproteins bArticleCancer riskCarcinoma, hepatocellularClinical featureCoalCohort analysisCombustionControlled studyDimethyl sulfateEnvironmental factorEpidemiologyFemaleGene clusterGene mutationGenetic associationGenetic traitGeneticsGenotoxicityHepatitis bHepatitis dHepatitis-delta virusHumanHuman tissueHumansLiver cell carcinomaLiver neoplasmsLiver tumorMajor clinical studyMaleMongoliaMongolian (people)MutationMutational analysisRna sequencingTranscriptomeTsc2 geneTumor mutational burdenTumor-related geneWhole exome sequencing

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Clinical Cancer Research a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició 22/241, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Oncology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 5.85, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Aug 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-08-05, el següent nombre de cites:

  • WoS: 9
  • Scopus: 6
  • Europe PMC: 8

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-08-05:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 32.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 36 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 65.85.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 78 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: France; Jersey; Mongolia; Singapore; United States of America.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Torrens Fontanals, Laura) i Últim Autor (Llovet Bayer, Josep M.).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Llovet Bayer, Josep M..