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Martinez Puchol, AnabelAutor o CoautorCampo, EAutor o CoautorMartinez, AAutor o Coautor

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20 de octubre de 2015
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Artículo
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Gene expression signatures delineate biological and prognostic subgroups in peripheral T-cell lymphoma

Publicado en:Blood. 123 (19): 2915-2923 - 2014-05-08 123(19), DOI: 10.1182/blood-2013-11-536359

Autores: Iqbal, Javeed; Wright, George; Wang, Chao; Rosenwald, Andreas; Gascoyne, Randy D; Weisenburger, Dennis D; Greiner, Timothy C; Smith, Lynette; Guo, Shuangping; Wilcox, Ryan A; Teh, Bin Tean; Lim, Soon Thye; Tan, Soon Yong; Rimsza, Lisa M; Jaffe, Elaine S; Campo, Elias; Martinez, Antonio; Delabie, Jan; Braziel, Rita M; Cook, James R; Tubbs, Raymond R; Ott, German; Geissinger, Eva; Gaulard, Philippe; Piccaluga, Pier Paolo; Pileri, Stefano A; Au, Wing Y; Nakamura, Shigeo; Seto, Masao; Berger, Francoise; de Leval, Laurence; Connors, Joseph M; Armitage, James; Vose, Julie; Chan, Wing C; Staudt, Louis M

Afiliaciones

Aichi Canc Ctr, Nagoya, Aichi 464, Japan - Autor o Coautor
Aichi Cancer Center, Nagoya, Japan - Autor o Coautor
British Columbia Canc Agcy, Ctr Lymphoid Canc, Vancouver, BC V5Z 4E6, Canada - Autor o Coautor
Centre for Lymphoid Cancer, British Columbia Cancer Agency, Centre for Lymphoid Cancers, Vancouver, BC, Canada - Autor o Coautor
Centre Hospitalier Lyon-Sud, Lyon, France - Autor o Coautor
CHU Vaudois, Univ Inst Pathol, CH-1011 Lausanne, Switzerland - Autor o Coautor
City Hope Natl Med Ctr, Dept Pathol, Duarte, CA 91010 USA - Autor o Coautor
Cleveland Clin, Dept Mol Pathol & Lab Med, Cleveland, OH 44106 USA - Autor o Coautor
Ctr Hosp Lyon Sud, Lyon, France - Autor o Coautor
Département de Pathologie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale U955, Université Paris Est, Créteil, France - Autor o Coautor
Department of Biostatistics, College of Public Health, University of Nebraska Medical Center, Omaha, NE, United States - Autor o Coautor
Department of Clinical Pathology, Oregon Health and Science University, Portland, OR, United States - Autor o Coautor
Department of Clinical Pathology, Robert-Bosch-Krankenhaus, Dr Margarete Fischer-Bosch Institute of Clinical Pharmacology, Stuttgart, Germany - Autor o Coautor
Department of Hematology/Oncology, University of Nebraska Medical Center, Omaha, NE, United States - Autor o Coautor
Department of Internal Medicine, University of Michigan Comprehensive Cancer Center, Ann Arbor, MI, United States - Autor o Coautor
Department of Molecular Pathology and Laboratory Medicine, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, United States - Autor o Coautor
Department of Pathology and Microbiology, University of Nebraska Medical Center, Omaha, NE, United States - Autor o Coautor
Department of Pathology, City of Hope National Medical Center, Duarte, CA, United States - Autor o Coautor
Department of Pathology, Norwegian Radium Hospital, University of Oslo, Oslo, Norway - Autor o Coautor
Department of Pathology, University of Arizona, Tucson, AZ, United States - Autor o Coautor
Dr Margarete Fischer Bosch Inst Clin Pharmacol, Stuttgart, Germany - Autor o Coautor
Duke Natl Univ Singapore, Grad Sch Med, Singapore, Singapore - Autor o Coautor
Hospital Clinic, Institut d'Investigacions Bomèdiques August Pi I Sunyer, University of Barcelona, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Institute of Hematology and Medical Oncology L. and A. Seràgnoli, S. Orsola-Malpighi Hospital, University of Bologna, Bologna, Italy - Autor o Coautor
Institute of Pathology, University of Würzburg, Würzburg, Germany - Autor o Coautor
Laboratory of Pathology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD, United States - Autor o Coautor
Metabolism Branch, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD 20892, United States - Autor o Coautor
National Cancer Center, Duke-National University of Singapore Graduate Medical School, Singapore, Singapore - Autor o Coautor
Natl Canc Ctr, Singapore, Singapore - Autor o Coautor
NCI, Metab Branch, Ctr Canc Res, NIH, Bethesda, MD 20892 USA - Autor o Coautor
NCI, Pathol Lab, Ctr Canc Res, NIH, Bethesda, MD 20892 USA - Autor o Coautor
Oregon Hlth & Sci Univ, Dept Clin Pathol, Portland, OR 97201 USA - Autor o Coautor
Queen Mary Hosp, Hong Kong, Hong Kong, Peoples R China - Autor o Coautor
Queen Mary Hospital, Hong Kong, Hong Kong - Autor o Coautor
Robert Bosch Krankenhaus, Dept Clin Pathol, Stuttgart, Germany - Autor o Coautor
Univ Arizona, Dept Pathol, Tucson, AZ USA - Autor o Coautor
Univ Barcelona, Hosp Clin, Inst Invest Bomed August Pi & Sunyer, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Univ Bologna, S Orsola Malpighi Hosp, Inst Hematol & Med Oncol L&A Seragnoli, Bologna, Italy - Autor o Coautor
Univ Michigan, Dept Internal Med, Ctr Comprehens Canc, Ann Arbor, MI 48109 USA - Autor o Coautor
Univ Nebraska Med Ctr, Coll Publ Hlth, Dept Biostat, Omaha, NE USA - Autor o Coautor
Univ Nebraska Med Ctr, Dept Hematol Oncol, Omaha, NE USA - Autor o Coautor
Univ Nebraska, Med Ctr, Dept Pathol & Microbiol, Omaha, NE 68198 USA - Autor o Coautor
Univ Oslo, Norwegian Radium Hosp, Dept Pathol, Oslo, Norway - Autor o Coautor
Univ Paris Est, Grp Henri Mondor Albert Chenevier, INSERM, Dept Pathol,U955, Creteil, France - Autor o Coautor
Univ Wurzburg, Inst Pathol, Wurzburg, Germany - Autor o Coautor
University Institute of Pathology, Centre Hospitalier Universitaire Vaudois, Lausanne, Switzerland - Autor o Coautor
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Resumen

Peripheral T-cell lymphoma (PTCL) encompasses a heterogeneous group of neoplasms with generally poor clinical outcome. Currently 50% of PTCL cases are not classifiable: PTCL-not otherwise specified (NOS). Gene-expression profiles on 372 PTCL cases were analyzed and robust molecular classifiers and oncogenic pathways that reflect the pathobiology of tumor cells and their microenvironment were identified for major PTCL-entities, including 114 angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL), 31 anaplastic lymphoma kinase (ALK)-positive and 48 ALK-negative anaplastic large cell lymphoma, 14 adult T-cell leukemia/lymphoma and 44 extranodal NK/T-cell lymphoma that were further separated into NK-cell and gdT-cell lymphomas. Thirty-seven percent of morphologically diagnosed PTCL-NOS cases were reclassified into other specific subtypes by molecular signatures. Reexamination, immunohistochemistry, and IDH2 mutation analysis in reclassified cases supported the validity of the reclassification. Two major molecular subgroups can be identified in the remaining PTCL-NOS cases characterized by high expression of either GATA3 (33%; 40/121) or TBX21 (49%; 59/121). The GATA3 subgroup was significantly associated with poor overall survival (P = .01). High expression of cytotoxic gene-signature within the TBX21 subgroup also showed poor clinical outcome (P = .05). In AITL, high expression of several signatures associated with the tumor microenvironment was significantly associated with outcome. A combined prognostic score was predictive of survival in an independent cohort (P = .004).

Palabras clave

differentiationeffectorfeaturesidentificationpredictionprofilesrecognitionsubtypessurvivalAdultAgedAged, 80 and overAnaplastic lymphoma kinaseAngioimmunoblastic t cell lymphomaArticleCancer prognosisCancer survivalChemokine receptor cxcr3ClassificationControlled studyDendritic cellsDna microarrayFemaleGamma interferonGene expressionGene expression profilingGene expression regulationGene expression regulation, neoplasticGenetic associationGeneticsHumanHuman tissueHumansImmunohistochemistryImmunophenotypingInterleukin 18 receptor alphaInterleukin 2 receptor betaLarge cell lymphomaLymphoma, t-cell, peripheralMacrophage inflammatory protein 1alphaMajor clinical studyMaleMessenger rnaMetabolismMiddle agedMolecular diagnosisMonocyte chemotactic protein 1Myc proteinNk t cell lymphomaNotch1 receptorOligonucleotide array sequence analysisOverall survivalPeripheral t cell lymphomaPriority journalPrognosisProtein expressionStromal cell derived factor 1SurvivalSurvival analysisT cell leukemiaT cell lymphomaTranscription factor gata 3Transcription factor t betTumor markerTumor markers, biologicalTumor microenvironmentVery elderlyYoung adult

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Blood debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2014, se encontraba en la posición 2/68, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Hematology.

Esta publicación ha sido distinguida como “Highly Cited Paper” según las agencias WoS (ESI, Clarivate) y ESI (Clarivate), lo que significa que se sitúa dentro del 1% superior de los artículos más citados en su campo temático durante el año de su publicación. En términos del impacto observado de la aportación, este trabajo es considerado como uno de los más influyentes a nivel mundial, al ser considerado como altamente citado. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Y así lo demuestran los altísimos impactos normalizados a través de algunos de los principales indicadores de este tipo, y que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, ya apuntan a estar muy por encima de la media en diferentes agencias:

  • Normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada (ESI) de la agencia Clarivate: 9.97 (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)
  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 6.26 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 100.75 (fuente consultada: Dimensions Aug 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-08-05, el siguiente número de citas:

  • WoS: 382
  • Scopus: 253
  • Europe PMC: 259

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-08-05:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 233.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 249 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 15.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Canada; China; France; Germany; Hong Kong; Italy; Japan; Norway; Singapore; Switzerland; United States of America.