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Grant support

This study was supported by a public grant attributed by the French Agence Nationale de la Recherche (ANR) as part of the second "Investissements d'Avenir" program (reference: ANR-17-RHUS-0003) to FZ and by "Investissement d'avenir" Laboratoires d'Excellence (LabEx) DEVweCAN (Cancer Development and Targeted Therapies) grant ANR-10-LABX-61 to FZ and BT; by Agence Nationale de Recherches sur le SIDA, les Hepatites Virales et les Maladies Infectieuses Emergentes (ANRS MIE) grant ECTZ75178 to BT and CB and fellowship ECTZ161842 to GG.

Análisis de autorías institucional

Chapus, FleurAutor o Coautor

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15 de abril de 2025
Publicaciones
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Artículo
No

Helicases DDX5 and DDX17 promote heterogeneity in HBV transcription termination in infected human hepatocytes

Publicado en:Journal Of Hepatology. 81 (4): - 2024-09-16 81(4), DOI: 10.1016/j.jhep.2024.05.016

Autores: Chapus, Fleur; Giraud, Guillaume; Huchon, Pelagie; Roda, Melanie; Grand, Xavier; Charre, Caroline; Goldsmith, Chloe; Suarez, Armando Andres Roca; Martinez, Maria-Guadalupe; Fresquet, Judith; Diederichs, Audrey; Locatelli, Maelle; Polveche, Helene; Scholtes, Caroline; Chemin, Isabelle; Vargas, Hector Hernandez; Rivoire, Michel; Bourgeois, Cyril F; Zoulim, Fabien; Testoni, Barbara

Afiliaciones

Canc Res Ctr Lyon CRCL, INSERM U1052, CNRS UMR 5286, Lyon, France - Autor o Coautor
CECS AFM, I Stem, F-91100 Corbeil Essonnes, France - Autor o Coautor
Ctr Leon Berard CLB, INSERM U1032, F-69008 Lyon, France - Autor o Coautor
Hosp Civils Lyon, Croix Rousse Hosp, Dept Virol, Lyon, France - Autor o Coautor
Hosp Civils Lyon, Dept Hepatol, Lyon, France - Autor o Coautor
Lyon Hepatol Inst EVEREST, Lyon, France - Autor o Coautor
Univ Claude Bernard Lyon, Ecole Normale Super Lyon, Lab Biol & Modelling Cell, INSERM U1293,CNRS UMR 5239, F-69007 Lyon, France - Autor o Coautor
Univ Lyon, UMR S1052, CRCL, F-69008 Lyon, France - Autor o Coautor
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Resumen

Background & Aims: Transcription termination fine-tunes gene expression and contributes to the specification of RNA function in eukaryotic cells. Transcription termination of HBV is subject to the recognition of the canonical polyadenylation signal (cPAS) common to all viral transcripts. However, the regulation of this cPAS and its impact on viral gene expression and replication is currently unknown. Methods: To unravel the regulation of HBV transcript termination, we implemented a 3' RACE (rapid amplification of cDNA ends)PCR assay coupled to single molecule sequencing both in in vitro-infected hepatocytes and in chronically infected patients. Results: The detection of a previously unidentified transcriptional readthrough indicated that the cPAS was not systematically recognized during HBV replication in vitro and in vivo. . Gene expression downregulation experiments demonstrated a role for the RNA helicases DDX5 and DDX17 in promoting viral transcriptional readthrough, which was, in turn, associated with HBV RNA destabilization and decreased HBx protein expression. RNA and chromatin immunoprecipitation, together with mutation of the cPAS sequence, suggested a direct role of DDX5 and DDX17 in functionally linking cPAS recognition to transcriptional read- through, HBV RNA stability and replication. Conclusions: Our findings identify DDX5 and DDX17 as crucial determinants of HBV transcriptional fidelity and as host restriction factors for HBV replication. (c) 2024 The Authors. Published by Elsevier B.V. on behalf of European Association for the Study of the Liver.

Palabras clave

Closed circular dnaGenHbPolyadenylationRna helicasesRna polyadenylationRna stabilityTranscription termination

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Journal Of Hepatology debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 3/143, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Gastroenterology & Hepatology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

2025-07-09:

  • WoS: 5

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-09:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 6.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 11 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 3.95.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: France.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Chapus, Fleur Lucie Stella) .