{rfName}
HN

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Kalisz MAutor o coautorBernardo EAutor o coautorBeucher AAutor o coautorMaestro, Miguel AngelAutor o coautorGrau VAutor o coautorVaquero EAutor o coautorFerrer JAutor (correspondència)

Compartir

15 demaig de 2020
Publicacions
>
Article

HNF1A recruits KDM6A to activate differentiated acinar cell programs that suppress pancreatic cancer

Publicat a: Embo Journal. 39 (9): e102808- - 2020-05-04 39(9), DOI: 10.15252/embj.2019102808

Autors: Kalisz, M; Bernardo, E; Beucher, A; Maestro, MA; del Pozo, N; Millan, I; Haeberle, L; Schlensog, M; Safi, SA; Knoefel, WT; Grau, V; de Vas, M; Shpargel, KB; Vaquero, E; Magnuson, T; Ortega, S; Esposito, I; Real, FX; Ferrer, J

Afiliacions

Barcelona Inst Sci & Technol BIST, Ctr Genom Regulat CRG, Bioinformat & Genom Program, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Bioinformatics and Genomics Program, Centre for Genomic Regulation (CRG), The Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain. - Autor o coautor
Centro de Investigacion Biomedica en Red de Diabetes y Enfermedades Metabolicas Asociadas (CIBERDEM), Barcelona, Spain. - Autor o coautor
CiberEHD, Institut de Malalties Digestives i Metabòliques, Hospital Clínic, IDIBAPS, Barcelona, Spain. - Autor o coautor
CIBERONC, Madrid, Spain - Autor o coautor
CIBERONC, Madrid, Spain. - Autor o coautor
Ctr Invest Biomed Red Diabet & Enfermedades Metab, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Departament de Ciències Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain. - Autor o coautor
Department of Genetics and Lineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC, USA. - Autor o coautor
Department of Surgery, Heinrich-Heine University and University Hospital of Düsseldorf, Düsseldorf, Germany. - Autor o coautor
Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre-CNIO, Madrid, Spain. - Autor o coautor
Heinrich Heine Univ, Dept Surg, Dusseldorf, Germany - Autor o coautor
Heinrich Heine Univ, Inst Pathol, Dusseldorf, Germany - Autor o coautor
Hosp Clin Barcelona, Inst Malalties Digest & Metabol, IDIBAPS, CiberEHD, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Imperial Coll London, Dept Med, Sect Epigen & Dis, London, England - Autor o coautor
Institute of Pathology, Heinrich-Heine University and University Hospital of Düsseldorf, Düsseldorf, Germany. - Autor o coautor
Section of Epigenomics and Disease, Department of Medicine, Imperial College London, London, UK. - Autor o coautor
Spanish Natl Canc Res Ctr CNIO, Epithelial Carcinogenesis Grp, Madrid, Spain - Autor o coautor
Spanish Natl Canc Res Ctr CNIO, Transgen Unit, Madrid, Spain - Autor o coautor
Transgenics Unit, Spanish National Cancer Research Centre-CNIO, Madrid, Spain. - Autor o coautor
Univ Hosp Dusseldorf, Dusseldorf, Germany - Autor o coautor
Univ N Carolina, Dept Genet, Chapel Hill, NC 27515 USA - Autor o coautor
Univ N Carolina, Lineberger Comprehens Canc Ctr, Chapel Hill, NC 27515 USA - Autor o coautor
Univ Pompeu Fabra, Dept Ciencies Expt & Salut, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Defects in transcriptional regulators of pancreatic exocrine differentiation have been implicated in pancreatic tumorigenesis, but the molecular mechanisms are poorly understood. The locus encoding the transcription factor HNF1A harbors susceptibility variants for pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), while KDM6A, encoding Lysine-specific demethylase 6A, carries somatic mutations in PDAC. Here, we show that pancreas-specific Hnf1a null mutant transcriptomes phenocopy those of Kdm6a mutations, and both defects synergize with KrasG12D to cause PDAC with sarcomatoid features. We combine genetic, epigenomic, and biochemical studies to show that HNF1A recruits KDM6A to genomic binding sites in pancreatic acinar cells. This remodels the acinar enhancer landscape, activates differentiated acinar cell programs, and indirectly suppresses oncogenic and epithelial-mesenchymal transition genes. We also identify a subset of non-classical PDAC samples that exhibit the HNF1A/KDM6A-deficient molecular phenotype. These findings provide direct genetic evidence that HNF1A deficiency promotes PDAC. They also connect the tumor-suppressive role of KDM6A deficiency with a cell-specific molecular mechanism that underlies PDAC subtype definition.© 2020 The Authors. Published under the terms of the CC BY 4.0 license.

Paraules clau

Acinar cellsAnimalsBindingCarcinoma, pancreatic ductalChip-seqEpigenesis, geneticExpressionGeneGene expression regulation, neoplasticGene regulatory networksHepatocyte nuclear factor 1-alphaHistone demethylase utxHistone demethylasesHnf1aHnf1a protein, humanHumansKdm6aKdm6a protein, humanMiceMutationMutationsNon-classical pdacOrgan specificityPancreasPancreas differentiationPancreatic neoplasmsSet enrichment analysisSubtypesTumorWeb server

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Embo Journal a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 22/295, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 2.15. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 13 Nov 2025)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.98 (font consultada: FECYT Mar 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-12-15, el següent nombre de cites:

  • WoS: 58
  • Scopus: 46
  • Europe PMC: 38

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-12-15:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 75.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 75 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 21.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 38 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Germany; United Kingdom; United States of America.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Bladé Creixenti, Joan) i Últim Autor (Ferrer Marrades, Jorge Pedro).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Ferrer Marrades, Jorge Pedro.

Reconeixements vinculats a l’ítem

Generalitat de Catalunya We thank I. Cobo, S. Paliwal, and members of the Ferrer laboratory for valuable discussions and Sonia Corral Leal for drawing and advising the design of the video synopsis. We thank the Parc de Recerca Biomedica de Barcelona and University of Barcelona School of Medicine animal facilities, Center of Genomic Regulation and Imperial College London Genomics Units, and the Imperial College High Performance Computing Service. This research was supported by the National Institute for Health Research (NIHR) Imperial Biomedical Research Centre. Work was funded by grants from the Wellcome Trust (WT101033 to J.F.), Medical Research Council (MR/L02036X/1 to J.F.), European Research Council Advanced Grant (789055 to J.F.), Ministerio de Ciencia e Innovacion (BFU2014-54284-R, RTI2018-095666-B-I00 to J.F., SAF2011-29530 and SAF2015-70553-R to F.X.R.) and RTICC from Instituto de Salud Carlos III (RD12/0036/0034, RD12/0036/0050) to F.X.R. M.K. was supported by a Juvenile Diabetes Research Foundation postdoctoral fellowship (3-PDF-2014-192-A-N). I.M. was supported by a Fellowship from Fundacio Bancaria La Caixa (ID 100010434) (grant number LCF/BQ/ES18/11670009). Work in CRG was supported by the CERCA Programme, Generalitat de Catalunya, and support from Ministerio de Ciencia e Innovacion to the EMBL partnership. Work at CRG and CNIO was supported by Centro de Excelencia Severo Ochoa grants SEV-2012-0208, SEV-2016-0510.