{rfName}
In

Indexat a

Llicència i ús

Altmetrics

Grant support

Ara Parseghian Medical Research Foundation Suzanne R Pfeffer; National Institutes of Health 5R01HL134991-04 Suzanne R Pfeffer; Chan Zuckerberg BioHub Joshua E Elias; The funders had no role in study design, data collection and interpretation, or the decision to submit the work for publication.

Anàlisi d'autories institucional

Lu López, AlbertAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

Inter-domain dynamics drive cholesterol transport by NPC1 and NPC1L1 proteins

Publicat a:Elife. 9 (e57089): - 2020-05-15 9(e57089), DOI: 10.7554/eLife.57089

Autors: Saha, P; Shumate, JL; Caldwell, JG; Elghobashi-Meinhardt, N; Lu, A; Zhang, LC; Olsson, NE; Elias, JE; Pfeffer, SR

Afiliacions

Calico Life Sci LLC, San Francisco, CA USA - Autor o coautor
Chan Zuckerberg BioHub, Stanford, CA USA - Autor o coautor
Merck Res Labs, San Francisco, CA USA - Autor o coautor
Stanford Univ, Sch Med, Dept Biochem, Stanford, CA 94305 USA - Autor o coautor
Stanford Univ, Sch Med, Dept Chem & Syst Biol, Stanford, CA 94305 USA - Autor o coautor
Tech Univ Berlin, Dept Chem, Berlin, Germany - Autor o coautor
Veure més

Resum

Transport of LDL-derived cholesterol from lysosomes into the cytoplasm requires NPC1 protein; NPC1L1 mediates uptake of dietary cholesterol. We introduced single disulfide bonds into NPC1 and NPC1L1 to explore the importance of inter-domain dynamics in cholesterol transport. Using a sensitive method to monitor lysosomal cholesterol efflux, we found that NPC1's N-terminal domain need not release from the rest of the protein for efficient cholesterol export. Either introducing single disulfide bonds to constrain lumenal/extracellular domains or shortening a cytoplasmic loop abolishes transport activity by both NPC1 and NPC1L1. The widely prescribed cholesterol uptake inhibitor, ezetimibe, blocks NPC1L1; we show that residues that lie at the interface between NPC1L1's three extracellular domains comprise the drug's binding site. These data support a model in which cholesterol passes through the cores of NPC1/NPC1L1 proteins; concerted movement of various domains is needed for transfer and ezetimibe blocks transport by binding to multiple domains simultaneously.

Paraules clau
biochemistrycell biologychemical biologycholesterol transportezetimibehumanldl cholesterollysosomeAbsorption inhibitorDeficientEzetimibe-sensitive cholesterolN-terminal domainNiemann pick c diseasePick c1 proteinPotentRequiresRolesSterol binding

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Elife a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 5/93, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 4.27, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions May 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-05-16, el següent nombre de cites:

  • WoS: 11
  • Scopus: 27
  • Google Scholar: 30
  • OpenCitations: 29
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-16:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 60.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 60 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 11.9.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 21 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Germany; United States of America.