{rfName}
A

Indexat a

Citacions

701

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Rubio-Perez, CarlotaAutor o coautor

Compartir

30 d’abril de 2025
Publicacions
>
Article
No

A Pan-cancer Landscape of Interactions between Solid Tumors and Infiltrating Immune Cell Populations

Publicat a: Clinical Cancer Research. 24 (15): 3717-3728 - 2018-08-01 24(15), DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-17-3509

Autors:

Tamborero, David; Rubio-Perez, Carlota; Muinos, Ferran; Sabarinathan, Radhakrishnan; Piulats, Josep M; Muntasell, Aura; Dienstmann, Rodrigo; Lopez-Bigas, Nuria; Gonzalez-Perez, Abel
[+]

Afiliacions

Barcelona Inst Sci & Technol, Inst Res Biomed, Barcelona 08028, Spain - Autor o coautor
Catalan Inst Res & Adv Studies ICREA, Barcelona, Spain - Autor o coautor
CIBERONC, Dept Med Oncol, Inst Catala Oncol IDIBELL, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Hosp del Mar, Res Inst, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Sage Bionetworks, Seattle, WA USA - Autor o coautor
Univ Pompeu Fabra, Dept Expt & Hlth Sci, Barcelona 08002, Spain - Autor o coautor
Vali dHebron Inst Oncol, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Purpose: Throughout their development, tumors are challenged by the immune system, and they acquire features to evade its surveillance. A systematic view of these traits, which shed light on how tumors respond to immunotherapies, is still lacking. Experimental Design: Here, we computed the relative abundance of an array of immune cell populations to measure the immune infiltration pattern of 9,174 tumors of 29 solid cancers. We then clustered tumors with similar infiltration pattern to define immunophenotypes. Finally, we identified genomic and transcriptomic traits associated to these immunophenotypes across cancer types. Results: In highly cytotoxic immunophenotypes, we found tumors with low clonal heterogeneity enriched for alterations of genes involved in epigenetic regulation, ubiquitin-mediated proteolysis, antigen presentation, and cell-cell communication, which may drive resistance in combination with the ectopic expression of negative immune checkpoints. Tumors with immunophenotypes of intermediate cytotoxicity are characterized by an upregulation of processes involved in neighboring tissue invasion and remodeling that may foster the recruitment of immunosuppressive cells. Tumors with poorly cytotoxic immunophenotype tend to be of more advanced stages and bear a greater burden of copy number alterations and frequent alterations of cell cycle, hedgehog, beta-catenin, and TGF-beta pathways, which may cause immune depletion. Conclusions: We provide a comprehensive landscape of the characteristics of solid tumors that may influence (or be influenced by) the characteristics of their immune infiltrate. These results may help interpret the response of solid tumors to immunotherapies and guide the development of novel drug combination strategies. (C) 2018 AACR.
[+]

Paraules clau

Acquired-resistanceBlockadeCd8-positive t-lymphocytesDna copy number variationsEpigenesis, geneticEvasionGene expression regulation, neoplasticGenomicsHumansImmunophenotypingImmunotherapyLymphocytes, tumor-infiltratingMetastatic melanomaMicroenvironmentNeoplasmsResponsesReveaTgf-betaTherapyTranscriptome

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista CLINICAL CANCER RESEARCH a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2018, es trobava a la posició 16/230, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Oncology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 7.32. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 13 Nov 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2026-04-04, el següent nombre de cites:

  • WoS: 235
  • Europe PMC: 210
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-04:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 278.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 278 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 33.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 48 (Altmetric).
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: United States of America.

[+]

Reconeixements vinculats a l’ítem

D. Tamborero is supported by project SAF2015-74072-JIN, which is funded by the Agencia Estatal de Investigacion (AEI) and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER). C. Rubio-Perez is supported by an FPI fellowship (BES-2013-063354) from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness. N. Lopez-Bigas acknowledges funding from the European Research Council (consolidator grant 682398). A. Gonzalez-Perez is supported by a Ramon y Cajal contract (RYC-2013-14554), which also covers the costs of this publication. The results shown here are in whole or part based upon data generated by the TCGA Research Network. Data generated by the Genotype-Tissue Expression (GTEx) Project, supported by the Common Fund of the Office of the Director of the National Institutes of Health, and by NCI, NHGRI, NHLBI, NIDA, NIMH, and NINDS, were also used. We thank Elena Gros (PhD) and Ignacio Melero (MD, PhD) for the scientific review and helpful discussions of the study, Fiorella Ruiz for the annotation of the TCGA clinical data, and Dvir Aran (PhD) for the support in the expression adjustment methodology. We also thank Eliezer Van Allen (MD, PhD) for providing the transcriptomic data of melanoma patients treated with anti-CTLA4 therapy.
[+]