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Investigadores/as Institucionales

Navarro Lopez, AlbaAutor o CoautorNadeu FAutor o CoautorMartin-Garcia DAutor o CoautorClot GAutor o CoautorDuran-Ferrer MAutor o CoautorNavarro AAutor o CoautorVilarrasa-Blasi RAutor o CoautorKulis, MAutor o CoautorValdes-Mas RAutor o CoautorLópez CAutor o CoautorChapaprieta, VAutor o CoautorCastellano GAutor o CoautorAymerich MAutor o CoautorJares PAutor o CoautorRibera-Cortada IAutor o CoautorColomer DAutor o CoautorGine EAutor o CoautorLópez-Guillermo AAutor o CoautorMartin-Subero IAutor o CoautorBea, SAutor (correspondencia)Campo EAutor (correspondencia)

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5 de julio de 2020
Publicaciones
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Artículo
No

Genomic and epigenomic insights into the origin, pathogenesis and clinical behavior of mantle cell lymphoma subtypes

Publicado en: Blood. 136 (12): 1419-1432 - 2020-09-17 136(12), DOI: 10.1182/blood.2020005289

Autores:

Nadeu, Ferran; Martin-Garcia, David; Clot, Guillem; Diaz-Navarro, Ander; Duran-Ferrer, Marti; Navarro, Alba; Vilarrasa-Blasi, Roser; Kulis, Marta; Royo, Romina; Gutierrez-Abril, Jesus; Valdes-Mas, Rafael; Lopez, Cristina; Chapaprieta, Vicente; Puiggros, Montserrat; Castellano, Giancarlo; Costa, Dolors; Aymerich, Marta; Jares, Pedro; Espinet, Blanca; Muntanola, Ana; Ribera-Cortada, Inmaculada; Siebert, Reiner; Colomer, Dolors; Torrents, David; Gine, Eva; Lopez-Guillermo, Armando; Kuppers, Ralf; Martin-Subero, Jose, I; Puente, Xose S; Bea, Silvia; Campo, Elias
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Afiliaciones

‎ Barcelona Supercomp Ctr, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain - Autor o Coautor
‎ German Consortium Canc Res, Heidelberg, Germany - Autor o Coautor
‎ Hosp Clin Barcelona, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Hosp Mar, Serv Patol, Lab Citogenet Mol, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Hosp Mutua Terrassa, Serv Hematol, Terrassa, Spain - Autor o Coautor
‎ Hosp Nostra Senyora Meritxell, Escaldes Engordany, Andorra La Vell, Andorra - Autor o Coautor
‎ IDIBAPS, Unitat Genom, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Inst Catalana Recerca & Estudis Avancats, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Inst Invest Biomed August Pi i Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Ulm Univ, Inst Human Genet, Ulm, Germany - Autor o Coautor
‎ Ulm Univ, Med Ctr, Ulm, Germany - Autor o Coautor
‎ Univ Barcelona, Dept Fonaments Clin, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
‎ Univ Duisburg Essen, Inst Cell Biol Canc Res, Essen, Germany - Autor o Coautor
‎ Univ Oviedo, Inst Univ Oncol, Dept Bioquim & Biol Mol, Oviedo, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Mantle cell lymphoma (MCL) is a mature B-cell neoplasm initially driven by CCND1 rearrangement with two molecular subtypes, conventional (cMCL) and leukemic non-nodal (nnMCL), that differ in their clinicobiological behavior. To identify the genetic/epigenetic alterations determining this diversity, we used whole-genome (n=61) and exome (n=21) sequencing (74% cMCL, 26% nnMCL) combined with transcriptome and DNA methylation profiles in the context of five MCL reference epigenomes. We identified that open and active chromatin at the major translocation cluster locus might facilitate the t(11;14)(q13;32), which modifies the 3-dimensional structure of the involved regions. This translocation is mainly acquired in precursor B cells mediated by RAG in both MCL subtypes, while in 8% of cases occurs in mature B cells mediated by AID. We identified novel recurrent MCL drivers, including CDKN1B, SAMHD1, BCOR, SYNE1, HNRNPH1, SMARCB1, and DAZAP1. Complex structural alterations emerge as a relevant early oncogenic mechanism in MCL targeting key driver genes. Breakage-fusion bridge cycles and translocations activated oncogenes (BMI1, MIR17HG, TERT, MYC, and MYCN), generating gene amplifications and remodeling regulatory regions. cMCL carried significant higher numbers of structural variants, copy number alterations, and driver changes than nnMCL, with exclusive alterations of ATM in cMCL, whereas TP53 and TERT alterations were slightly enriched in nnMCL. Several drivers had prognostic impact, but only TP53 and MYC aberrations added value independently of genomic complexity. An increasing genomic complexity together with the presence of breakage-fusion bridge cycles and high DNA methylation changes related to the proliferative cell history discriminate patients with different clinical evolution.Copyright © 2020 American Society of Hematology.
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Palabras clave

evolutionexpressiongenelandscapemechanismsmethylationmutationsoccurtp53AdultAgedAged, 80 and overCcnd1 protein, humanCell proliferationChromosomal translocationsCyclin d1Dna methylationEpigenesis, geneticFemaleGene expression regulation, neoplasticGene rearrangementGenomicsHumansImmunoglobulinsLymphoma, mantle-cellMaleMiddle agedMutation

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista BLOOD debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 1/76, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Hematology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 7.29. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 5.83 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-02, el siguiente número de citas:

  • WoS: 167
  • Scopus: 141
  • Europe PMC: 79
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 167.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 165 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 57.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 6 (Altmetric).
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Andorra; Germany.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Nadeu Prat, Ferran) y Último Autor (Campo Güerri, Elías).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido Beà Bobet, Sílvia y Campo Güerri, Elías.

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Reconocimientos ligados al ítem

This work was supported by research funding from Fondo de Investigaciones Sanitarias, Instituto de Salud Carlos III (PI17/01061 to S.B.); National Institutes of Health, National Cancer Institute Molecular Diagnosis, Prognosis, and Therapeutic Targets in Mantle Cell Lymphoma (P01CA229100 to E.C.); Ministerio de Ciencia e Innovacion (RTI2018094274-B-I00 to E.C., SAF2017-87811-R to X.S.P., and SAF2017-86126R to J.I.M.-S.); Generalitat de Catalunya Suport Grups de Recerca AGAUR (2017-SGR-1142 to E.C., and AGAUR 2017-SGR-736 to J.I.M.-S.); German Ministry of Science and Education in the framework of the ICGC MMML-Seq (01KU1002) and ICGC DE-Mining (01KU1505) to R.S. F.N. is supported by a predoctoral fellowship of the Ministerio de Ciencia e Innovacion (BES-2016-076372). A.D.-N. is supported by the Department of Education of the Basque Government (PRE_2017_1_0100). E.C. is an Academia Researcher of the Institucio Catalana de Recerca i Estudis Avancats of the Generalitat de Catalunya.
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