{rfName}
Mi

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

136

Altmetrics

Grant support

The present work was supported by grants from Instituto de Salud Carlos III (PI10/02888 and PI13/02192, co-funded by FEDER-European Union) and Fundacion Mutua Madrilena to MG, and Fundacion Cientifica de la Asociacion Espanola contra el Cancer (GCB13131592CAST) and Ministerio de Economia y Competitividad (SAF2014-54453-R) to AC. CIBEREHD is funded by the Instituto de Salud Carlos III. This work was developed at the Centro Esther Koplowitz, Barcelona, Spain. MV-C is funded by Ministerio de Educacion Cultura y Deporte (FPU12/05138).

Anàlisi d'autories institucional

Fernández Esparrach, GloriaAutor o coautorVila-Navarro, EAutor o coautorVila-Casadesús, MAutor o coautorMoreira, LAutor o coautorDuran-Sanchon, SAutor o coautorSinha, RAutor o coautorGines, AAutor o coautorCuatrecasas, MAutor o coautorCastells, AAutor o coautorGironella, MAutor (correspondència)

Compartir

31 demaig de 2016
Publicacions
>
Article
No

MicroRNAs for Detection of Pancreatic Neoplasia: Biomarker Discovery by Next-generation Sequencing and Validation in 2 Independent Cohorts

Publicat a:Annals Of Surgery. 265 (6): 1226-1234 - 2017-06-01 265(6), DOI: 10.1097/SLA.0000000000001809

Autors: Vila-Navarro, Elena; Vila-Casadesus, Maria; Moreira, Leticia; Duran-Sanchon, Saray; Sinha, Rupal; Gines, Angels; Fernandez-Esparrach, Gloria; Miquel, Rosa; Cuatrecasas, Miriam; Castells, Antoni; Jose Lozano, Juan; Gironella, Meritxell

Afiliacions

CIBEREHD Barcelona, Bioinformat Platform, Catalonia, Spain - Autor o coautor
Hosp Clin Barcelona, Pathol Dept, Barcelona, Catalonia, Spain - Autor o coautor
Univ Barcelona, Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, Gastrointestinal & Pancreat Oncol Grp,Hosp Clin B, Barcelona, Catalonia, Spain - Autor o coautor

Resum

The aim of our study was to analyze the miRNome of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and its preneoplastic lesion intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN), to find new microRNA (miRNA)-based biomarkers for early detection of pancreatic neoplasia.Effective early detection methods for PDAC are needed. miRNAs are good biomarker candidates.Pancreatic tissues (n = 165) were obtained from patients with PDAC, IPMN, or from control individuals (C), from Hospital Clínic of Barcelona. Biomarker discovery was done using next-generation sequencing in a discovery set of 18 surgical samples (11 PDAC, 4 IPMN, 3 C). MiRNA validation was carried out by quantitative reverse transcriptase PCR in 2 different set of samples. Set 1-52 surgical samples (24 PDAC, 7 IPMN, 6 chronic pancreatitis, 15 C), and set 2-95 endoscopic ultrasound-guided fine-needle aspirations (60 PDAC, 9 IPMN, 26 C).In all, 607 and 396 miRNAs were significantly deregulated in PDAC and IPMN versus C. Of them, 40 miRNAs commonly overexpressed in both PDAC and IPMN were selected for further validation. Among them, significant up-regulation of 31 and 30 miRNAs was confirmed by quantitative reverse transcriptase PCR in samples from set 1 and set 2, respectively.miRNome analysis shows that PDAC and IPMN have differential miRNA profiles with respect to C, with a large number of deregulated miRNAs shared by both neoplastic lesions. Indeed, we have identified and validated 30 miRNAs whose expression is significantly increased in PDAC and IPMN lesions. The feasibility of detecting these miRNAs in endoscopic ultrasound-guided fine-needle aspiration samples makes them good biomarker candidates for early detection of pancreatic cancer.

Paraules clau

biomarkerscancercarcinomadiagnosisductal adenocarcinomaeus-fnaexpressionipmnmir-155mirnapancreatic cancerrnastumor markertumorigenesisBiomarkers, tumorCarcinoma, pancreatic ductalCarcinoma, papillaryDeep sequencingEarly detection of cancerEus-fnaGene expression profilingHumansIpmnMicrornasMirnaPancreatic cancerPancreatic neoplasmsPapillary-mucinous neoplasmsPrecancerous conditionsReverse transcriptase polymerase chain reactionTumor marker

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Annals Of Surgery a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2017, es trobava a la posició 1/200, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Surgery. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 2.48. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.98 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 13.14 (font consultada: Dimensions Aug 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-08-04, el següent nombre de cites:

  • WoS: 47
  • Scopus: 36
  • Europe PMC: 34

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-08-04:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 74.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 96 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 7.2.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 11 (Altmetric).

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Vila Navarro, Elena) i Últim Autor (Gironella Cos, Meritxell).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Gironella Cos, Meritxell.