{rfName}
Th

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Jodar, Mercedes Soledad NabaesAutor (correspondència)

Compartir

20 defebrer de 2025
Publicacions
>
Article

The Lambda Variant in Argentina: Analyzing the Evolution and Spread of SARS-CoV-2 Lineage C.37

Publicat a: Viruses-Basel. 15 (6): 1382- - 2023-06-01 15(6), DOI: 10.3390/v15061382

Autors:

Jodar, Mercedes Soledad Nabaes; Torres, Carolina; Mojsiejczuk, Laura; Acuna, Dolores; Valinotto, Laura Elena; Goya, Stephanie; Natale, Monica; Lusso, Silvina; Alexay, Sofia; Amadio, Ariel; Irazoqui, Matias; Fernandez, Franco; Acevedo, Maria Elina; Lopez, Cristina Alvarez; Angelletti, Andres; Aulicino, Paula; Bolatti, Elisa; Bruses, Bettina; Cacciahue, Marco; Cavatorta, Ana; Cerri, Agustina; Cordero, Andres; Debat, Humberto; Santos, Maria Jose Dus; Eberhardt, Maria Florencia; Ercole, Regina; Espul, Carlos; Farber, Marisa; Fay, Fabian; Fernandez, Ailen; Ferrini, Florencia; Formichelli, Laura; Ceballos, Santiago; Gallego, Fernando; Giri, Adriana; Gismondi, Maria; Acevedo, Raul Maximiliano; Gramundi, Ivan; Ibanez, Maria Eugenia; Konig, Guido; Leiva, Viviana; Lorenzini Campos, Melina; Lucero, Horacio; Marquez, Nathalie; Mazzeo, Melina; Mistchenko, Alicia Susana; Montoto, Luciana; Munoz, Marianne; Nadalich, Victoria; Nardi, Cristina; Ortiz, Belen; Pianciola, Luis; Pintos, Carolina; Puebla, Andrea; Rastellini, Carolina; Rojas, Alejandro Ezequiel; Sfalcin, Javier; Suarez, Ariel; Theaux, Clara; Thomas, Guillermo; Tittarelli, Estefania; Toro, Rosana; Villanova, Vanina; Wenk, Gretel; Ziehm, Cecilia; Zimmermann, Maria Carla; Zunino, Sebastian; Pais, Proyecto; Viegas, Mariana
[+]

Afiliacions

CIBIC Lab, Pte Roca 746, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o coautor
Comis Invest Cient Prov Buenos Aires, Camino Gen Belgrano & 526, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn CONICET, Godoy Cruz 2390, RA-2915 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Grp Virol Humana, Inst Biol Mol & Celular Rosario, Suipacha 590, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Biotecnol, Inst Agrobiotecnol & Biol Mol INTA, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Invest Cadena Lactea IDICAl, INTA, Ruta 34 Km 227, RA-2300 Rafaela, Argentina - Autor o coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Virol & Innovac Tecnol INTA, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o coautor
Consorcio Argentino Genom SARS CoV 2, Proyecto Argentino Interinst Genom SARS CoV 2, Gallo 1330, RA-1425 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
HIEAyC San Juan de Dios, Lab Virol, Calles 27 & 70, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o coautor
Hosp Aleman, Biol Mol Lab Cent, Ave Pueyrredon 1640, RA-1118 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Hosp Blas L Dubarry, Lab Virol Mol, Calle 12 825, RA-6600 Mercedes, Argentina - Autor o coautor
Hosp Gen Agudos, Lab Biol Mol, Diaz Velez 5044, RA-1405 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Hosp Ninos Dr Ricardo Gutierrez, Lab Virol, Gallo 1330, RA-1425 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Hosp Pediat Prof Juan P Garrahan, Lab Biol Celular & Retrovirus, Ave Brasil 1175, RA-1260 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Hosp Pedro de Elizalde, Lab Biol Mol, Ave Manuel A Montes Oca 1402, RA-1270 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Hosp Reg Ushuaia, Ave 12 Octubre & Maipu, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o coautor
IACA Labs, Dept Biol & Genet Mol, San Martin 68, RA-8000 Bahia Blanca, Argentina - Autor o coautor
Inst Invest Bacteriol & Virol Mol IbaViM, Junin 956, RA-1113 Buenos Aires, Argentina - Autor o coautor
Inst Nacl Tecnol Agr, Inst Patol Vegetal, Ctr Invest Agr, Camino 60 Cuadras Km 5,5, RA-5020 Cordoba, Argentina - Autor o coautor
Lab Mixto Biotecnol Acuat, Ave Eduardo Carrasco & Cordiviola, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o coautor
Lab Salud Publ, Talcahuano 2194, RA-5501 Godoy Cruz, Argentina - Autor o coautor
Minist Salud Prov Mendoza, Direcc Epidemiol & Red Labs, RA-5500 Mendoza, Argentina - Autor o coautor
Minist Salud, Lab Cent Ciudad Neuquen, Gregorio Martinez 65, RA-8300 Neuquen, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Hurlingham, Lab Diagnost UNIDAD COVID, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl La Plata, Fac Ciencias Exactas, Lab Salud Publ, Calle 1 & 47, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Nordeste, Fac Med, Lab Med Genom, RA-1430 Cordoba, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Nordeste, Inst Med Reg, Ave Las Heras 727, RA-3500 Resistencia, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Rosario UNR, Fac Ciencias Bioquim & Farmaceut, Ctr Tecnol Salud Publ, Suipacha 531, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Tierra Del Fuego UNTDF, Inst Ciencias Polares Ambiente & Recursos Nat ICP, Houssay 200, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o coautor
Univ Nacl Tierra Del Fuego, Cadic Conicet, Houssay 200, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o coautor
UNNE, Inst Bot Nordeste, Sargento Juan Bautista Cabral 2131, RA-3400 Corrientes, Argentina - Autor o coautor
Veure més

Resum

The second wave of COVID-19 occurred in South America in early 2021 and was mainly driven by Gamma and Lambda variants. In this study, we aimed to describe the emergence and local genomic diversity of the SARS-CoV-2 Lambda variant in Argentina, from its initial entry into the country until its detection ceased. Molecular surveillance was conducted on 9356 samples from Argentina between October 2020 and April 2022, and sequencing, phylogenetic, and phylogeographic analyses were performed. Our findings revealed that the Lambda variant was first detected in Argentina in January 2021 and steadily increased in frequency until it peaked in April 2021, with continued detection throughout the year. Phylodynamic analyses showed that at least 18 introductions of the Lambda variant into the country occurred, with nine of them having evidence of onward local transmission. The spatial--temporal reconstruction showed that Argentine clades were associated with Lambda sequences from Latin America and suggested an initial diversification in the Metropolitan Area of Buenos Aires before spreading to other regions in Argentina. Genetic analyses of genome sequences allowed us to describe the mutational patterns of the Argentine Lambda sequences and detect the emergence of rare mutations in an immunocompromised patient. Our study highlights the importance of genomic surveillance in identifying the introduction and geographical distribution of the SARS-CoV-2 Lambda variant, as well as in monitoring the emergence of mutations that could be involved in the evolutionary leaps that characterize variants of concern.
[+]

Paraules clau

AlignmenArgentinaCovid-19EvolutionHumansLambdaMutationPerformancePhylodynamiPhylodynamicPhylogenySars-cov-2South americaVariants

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Viruses-Basel a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2023, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Infectious Diseases.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-02:

  • WoS: 2
  • Europe PMC: 2
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 8.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 8 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 1.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Argentina.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Nabaes Jodar, Mercedes Soledad) .

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Nabaes Jodar, Mercedes Soledad.

[+]

Reconeixements vinculats a l’ítem

The sequencing strategy was supported by Proyecto IP COVID-19 N degrees 08 (Ministerio de Ciencia, Tecnologia e Innovacion, Argentina) and Focem COF 03/11 COVID-19 (Fondo para la Convergencia Estructural del MERCOSUR).
[+]