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Jodar, Mercedes Soledad NabaesAutor (correspondencia)

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20 de febrero de 2025
Publicaciones
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Artículo

The Lambda Variant in Argentina: Analyzing the Evolution and Spread of SARS-CoV-2 Lineage C.37

Publicado en: Viruses-Basel. 15 (6): 1382- - 2023-06-01 15(6), DOI: 10.3390/v15061382

Autores:

Jodar, Mercedes Soledad Nabaes; Torres, Carolina; Mojsiejczuk, Laura; Acuna, Dolores; Valinotto, Laura Elena; Goya, Stephanie; Natale, Monica; Lusso, Silvina; Alexay, Sofia; Amadio, Ariel; Irazoqui, Matias; Fernandez, Franco; Acevedo, Maria Elina; Lopez, Cristina Alvarez; Angelletti, Andres; Aulicino, Paula; Bolatti, Elisa; Bruses, Bettina; Cacciahue, Marco; Cavatorta, Ana; Cerri, Agustina; Cordero, Andres; Debat, Humberto; Santos, Maria Jose Dus; Eberhardt, Maria Florencia; Ercole, Regina; Espul, Carlos; Farber, Marisa; Fay, Fabian; Fernandez, Ailen; Ferrini, Florencia; Formichelli, Laura; Ceballos, Santiago; Gallego, Fernando; Giri, Adriana; Gismondi, Maria; Acevedo, Raul Maximiliano; Gramundi, Ivan; Ibanez, Maria Eugenia; Konig, Guido; Leiva, Viviana; Lorenzini Campos, Melina; Lucero, Horacio; Marquez, Nathalie; Mazzeo, Melina; Mistchenko, Alicia Susana; Montoto, Luciana; Munoz, Marianne; Nadalich, Victoria; Nardi, Cristina; Ortiz, Belen; Pianciola, Luis; Pintos, Carolina; Puebla, Andrea; Rastellini, Carolina; Rojas, Alejandro Ezequiel; Sfalcin, Javier; Suarez, Ariel; Theaux, Clara; Thomas, Guillermo; Tittarelli, Estefania; Toro, Rosana; Villanova, Vanina; Wenk, Gretel; Ziehm, Cecilia; Zimmermann, Maria Carla; Zunino, Sebastian; Pais, Proyecto; Viegas, Mariana
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Afiliaciones

CIBIC Lab, Pte Roca 746, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o Coautor
Comis Invest Cient Prov Buenos Aires, Camino Gen Belgrano & 526, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o Coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn CONICET, Godoy Cruz 2390, RA-2915 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Grp Virol Humana, Inst Biol Mol & Celular Rosario, Suipacha 590, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o Coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Biotecnol, Inst Agrobiotecnol & Biol Mol INTA, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o Coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Invest Cadena Lactea IDICAl, INTA, Ruta 34 Km 227, RA-2300 Rafaela, Argentina - Autor o Coautor
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Inst Virol & Innovac Tecnol INTA, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o Coautor
Consorcio Argentino Genom SARS CoV 2, Proyecto Argentino Interinst Genom SARS CoV 2, Gallo 1330, RA-1425 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
HIEAyC San Juan de Dios, Lab Virol, Calles 27 & 70, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Aleman, Biol Mol Lab Cent, Ave Pueyrredon 1640, RA-1118 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Blas L Dubarry, Lab Virol Mol, Calle 12 825, RA-6600 Mercedes, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Gen Agudos, Lab Biol Mol, Diaz Velez 5044, RA-1405 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Ninos Dr Ricardo Gutierrez, Lab Virol, Gallo 1330, RA-1425 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Pediat Prof Juan P Garrahan, Lab Biol Celular & Retrovirus, Ave Brasil 1175, RA-1260 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Pedro de Elizalde, Lab Biol Mol, Ave Manuel A Montes Oca 1402, RA-1270 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Hosp Reg Ushuaia, Ave 12 Octubre & Maipu, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o Coautor
IACA Labs, Dept Biol & Genet Mol, San Martin 68, RA-8000 Bahia Blanca, Argentina - Autor o Coautor
Inst Invest Bacteriol & Virol Mol IbaViM, Junin 956, RA-1113 Buenos Aires, Argentina - Autor o Coautor
Inst Nacl Tecnol Agr, Inst Patol Vegetal, Ctr Invest Agr, Camino 60 Cuadras Km 5,5, RA-5020 Cordoba, Argentina - Autor o Coautor
Lab Mixto Biotecnol Acuat, Ave Eduardo Carrasco & Cordiviola, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o Coautor
Lab Salud Publ, Talcahuano 2194, RA-5501 Godoy Cruz, Argentina - Autor o Coautor
Minist Salud Prov Mendoza, Direcc Epidemiol & Red Labs, RA-5500 Mendoza, Argentina - Autor o Coautor
Minist Salud, Lab Cent Ciudad Neuquen, Gregorio Martinez 65, RA-8300 Neuquen, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Hurlingham, Lab Diagnost UNIDAD COVID, RA-1686 Hurlingham, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl La Plata, Fac Ciencias Exactas, Lab Salud Publ, Calle 1 & 47, RA-1900 La Plata, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Nordeste, Fac Med, Lab Med Genom, RA-1430 Cordoba, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Nordeste, Inst Med Reg, Ave Las Heras 727, RA-3500 Resistencia, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Rosario UNR, Fac Ciencias Bioquim & Farmaceut, Ctr Tecnol Salud Publ, Suipacha 531, RA-2000 Rosario, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Tierra Del Fuego UNTDF, Inst Ciencias Polares Ambiente & Recursos Nat ICP, Houssay 200, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o Coautor
Univ Nacl Tierra Del Fuego, Cadic Conicet, Houssay 200, RA-9410 Ushuaia, Argentina - Autor o Coautor
UNNE, Inst Bot Nordeste, Sargento Juan Bautista Cabral 2131, RA-3400 Corrientes, Argentina - Autor o Coautor
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Resumen

The second wave of COVID-19 occurred in South America in early 2021 and was mainly driven by Gamma and Lambda variants. In this study, we aimed to describe the emergence and local genomic diversity of the SARS-CoV-2 Lambda variant in Argentina, from its initial entry into the country until its detection ceased. Molecular surveillance was conducted on 9356 samples from Argentina between October 2020 and April 2022, and sequencing, phylogenetic, and phylogeographic analyses were performed. Our findings revealed that the Lambda variant was first detected in Argentina in January 2021 and steadily increased in frequency until it peaked in April 2021, with continued detection throughout the year. Phylodynamic analyses showed that at least 18 introductions of the Lambda variant into the country occurred, with nine of them having evidence of onward local transmission. The spatial--temporal reconstruction showed that Argentine clades were associated with Lambda sequences from Latin America and suggested an initial diversification in the Metropolitan Area of Buenos Aires before spreading to other regions in Argentina. Genetic analyses of genome sequences allowed us to describe the mutational patterns of the Argentine Lambda sequences and detect the emergence of rare mutations in an immunocompromised patient. Our study highlights the importance of genomic surveillance in identifying the introduction and geographical distribution of the SARS-CoV-2 Lambda variant, as well as in monitoring the emergence of mutations that could be involved in the evolutionary leaps that characterize variants of concern.
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Palabras clave

AlignmenArgentinaCovid-19EvolutionHumansLambdaMutationPerformancePhylodynamiPhylodynamicPhylogenySars-cov-2South americaVariants

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Viruses-Basel debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Infectious Diseases.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-02:

  • WoS: 2
  • Europe PMC: 2
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 8.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 8 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 1.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Argentina.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Nabaes Jodar, Mercedes Soledad) .

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Nabaes Jodar, Mercedes Soledad.

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Reconocimientos ligados al ítem

The sequencing strategy was supported by Proyecto IP COVID-19 N degrees 08 (Ministerio de Ciencia, Tecnologia e Innovacion, Argentina) and Focem COF 03/11 COVID-19 (Fondo para la Convergencia Estructural del MERCOSUR).
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